Los patobiomas específicos, como los transmitidos por las semillas, los establecidos en la rizosfera y las comunidades fitopatógenas foliares, tienen un impacto significativo en el rendimiento y la calidad de los cultivos. Aquí dos ejemplos:
Estos patobiomas pueden reducir la germinación de las semillas, disminuir su vigor y provocar pérdidas de rendimiento que oscilan entre el 15 y el 90%. Las enfermedades foliares pueden afectar la calidad de molienda y uso final de los granos al alterar la relación N/carbohidratos. Estas enfermedades pueden conducir a un menor crecimiento de los cultivos, lo que resulta en menos granos y un menor peso, lo que en última instancia afecta la acumulación de N en los granos. Los patobiomas foliares dominados por entidades fúngicas no sólo afectan la gravedad del patógeno sino que también afectan la asimilación de carbono en el cultivo. Las enfermedades foliares del pueden influir en la capacidad fotosintética y la permanencia de tejidos saludables, provocando pérdidas de materia seca, acumulación de N en el grano y GPC. Las investigaciones han mostrado más información sobre el efecto de las enfermedades foliares en las pérdidas de rendimiento de materia seca en comparación con el rendimiento de N y la proteina en los granos. En general, las enfermedades foliares fúngicas pueden disminuir la tasa de crecimiento de los cultivos , lo que a su vez afecta la capacidad del cultivo para interceptar y acumular radiación fotosintéticamente activa, lo que en última instancia afecta la acumulación de biomasa aérea y el rendimiento de granos.
Estudios documentan hongos patógenos que causan enfermedades, junto con mohos que afectan el crecimiento y la calidad del cannabis. Los mohos son hongos que se encuentran en materiales vegetales vivos o muertos no asociados con síntomas de enfermedades y pueden ser contaminantes incidentales en el aire o en sustratos en crecimiento. Estos patógenos y mohos se descubrieron en plantas de cannabis durante el cultivo en diversos entornos, así como en campos al aire libre. Se han encontrado patógenos como Fusarium y Pythium en los sistemas de raíces de las plantas de cannabis, lo que provocó pardeamiento, descomposición, retraso en el crecimiento, coloración amarillenta y, en ocasiones, la muerte de las plantas.
Las fuentes potenciales de inóculo para estos patógenos pueden provenir de sustratos de cultivo contaminados, esquejes enfermos y propágulos transportados por el aire o el agua, así como también inóculo residual de cultivos anteriores. Los patógenos pueden reproducirse en tejidos enfermos, aumentando la carga de inóculo y propagándose dentro de una instalación de cultivo de cannabis. Es importante implementar métodos de desinfección para minimizar la introducción y propagación de patógenos. Los mohos transportados por el aire, como el Cladosporium y varias especies de Penicillium, son contaminantes habituales de las inflorescencias del cannabis. Además, la pudrición de los cogollos por Botrytis puede ser un desafío para los productores durante la producción y después de la cosecha. Si bien es posible que los patógenos que infectan las raíces no dañen visiblemente el crecimiento de las plantas a menos que la infección ocurra temprano, la destrucción de las raíces puede provocar reducciones desconocidas en el rendimiento y la calidad. La infección por mildiú polvoso se encuentra a menudo en las instalaciones de producción y necesitará un manejo proactivo y el uso potencial de selecciones genéticas resistentes a enfermedades.